Bitte benutzen Sie diese Referenz, um auf diese Ressource zu verweisen:
Volltext verfügbar? / Dokumentlieferung
doi:10.22028/D291-29437
Titel: | MeDeCom: Discovery and Quantification of Latent Components of Heterogeneous Methylomes |
VerfasserIn: | Lutsik, Pavlo Slawski, Martin Gasparoni, Gilles Vedeneev, Nikita Hein, Matthias Walter, Jörn Erik |
Sprache: | Englisch |
Titel: | Genome biology : biology for the post-genomic era |
Bandnummer: | 18 |
Heft: | 1 |
Startseite: | 1 |
Endseite: | 20 |
Verlag/Plattform: | BioMed Central |
Erscheinungsjahr: | 2017 |
Dokumenttyp: | Journalartikel / Zeitschriftenartikel |
Abstract: | It is important for large-scale epigenomic studies to determine and explore the nature of hidden confounding variation, most importantly cell composition. We developed MeDeCom as a novel reference-free computational framework that allows the decomposition of complex DNA methylomes into latent methylation components and their proportions in each sample. MeDeCom is based on constrained non-negative matrix factorization with a new biologically motivated regularization function. It accurately recovers cell-type-specific latent methylation components and their proportions. MeDeCom is a new unsupervised tool for the exploratory study of the major sources of methylation variation, which should lead to a deeper understanding and better biological interpretation. |
DOI der Erstveröffentlichung: | 10.1186/s13059-017-1182-6 |
URL der Erstveröffentlichung: | https://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059-017-1182-6 |
Link zu diesem Datensatz: | hdl:20.500.11880/27893 http://dx.doi.org/10.22028/D291-29437 |
ISSN: | 1465-6914 1474-760X |
Datum des Eintrags: | 25-Sep-2019 |
Fakultät: | NT - Naturwissenschaftlich- Technische Fakultät |
Fachrichtung: | NT - Biowissenschaften |
Professur: | NT - Prof. Dr. Jörn Walter |
Sammlung: | SciDok - Der Wissenschaftsserver der Universität des Saarlandes |
Dateien zu diesem Datensatz:
Es gibt keine Dateien zu dieser Ressource.
Alle Ressourcen in diesem Repository sind urheberrechtlich geschützt.