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Titel: A protocol for CRISPR-mediated activation and repression of human endogenous retroviruses in human pluripotent stem cells
VerfasserIn: Nair, Vidya Padmanabhan
Mayer, Jens UdsID
Vincendeau, Michelle
Sprache: Englisch
In:
Titel: STAR Protocols
Bandnummer: 3
Heft: 2
Verlag/Plattform: Elsevier
Erscheinungsjahr: 2022
DDC-Sachgruppe: 610 Medizin, Gesundheit
Dokumenttyp: Journalartikel / Zeitschriftenartikel
Abstract: Human endogenous retroviruses (HERVs) comprise many regulatory elements and can regulate host gene activity at different expression levels via multiple mechanisms. Here, we introduce a step-by-step protocol to activate or repress transcription of HERV-K(HML-2) elements using the CRISPRa and CRISPRi technologies in human embryonic stem cells. This protocol can help deciphering the functional role of HERV-K(HML-2) elements in critical biological processes. The protocol may easily be adapted to other cell lines and HERV groups with relatively low sequence heterogeneity. For complete details on the use and execution of this protocol, please refer to Padmanabhan Nair et al. (2021).
DOI der Erstveröffentlichung: 10.1016/j.xpro.2022.101281
URL der Erstveröffentlichung: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2666166722001617
Link zu diesem Datensatz: urn:nbn:de:bsz:291--ds-444998
hdl:20.500.11880/39754
http://dx.doi.org/10.22028/D291-44499
ISSN: 2666-1667
Datum des Eintrags: 5-Mär-2025
Fakultät: M - Medizinische Fakultät
Fachrichtung: M - Humangenetik
Professur: M - Prof. Dr. Eckart Meese
Sammlung:SciDok - Der Wissenschaftsserver der Universität des Saarlandes



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