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doi:10.22028/D291-44181
Titel: | In silico read normalization using set multi-cover optimization |
VerfasserIn: | Durai, Dilip Schulz, Marcel H. |
Sprache: | Englisch |
Titel: | Bioinformatics |
Bandnummer: | 34 |
Heft: | 19 |
Seiten: | 3273-3280 |
Verlag/Plattform: | Oxford Univ. Press |
Erscheinungsjahr: | 2018 |
DDC-Sachgruppe: | 004 Informatik |
Dokumenttyp: | Journalartikel / Zeitschriftenartikel |
Abstract: | De Bruijn graphs are a common assembly data structure for sequencing datasets. But with the advances in sequencing technologies, assembling high coverage datasets has become a computational challenge. Read normalization, which removes redundancy in datasets, is widely applied to reduce resource requirements. Current normalization algorithms, though efficient, provide no guarantee to preserve important k-mers that form connections between regions in the graph. |
DOI der Erstveröffentlichung: | 10.1093/bioinformatics/bty307 |
URL der Erstveröffentlichung: | https://academic.oup.com/bioinformatics/article/34/19/3273/4975418 |
Link zu diesem Datensatz: | urn:nbn:de:bsz:291--ds-441812 hdl:20.500.11880/39514 http://dx.doi.org/10.22028/D291-44181 |
ISSN: | 1367-4811 1367-4803 |
Datum des Eintrags: | 28-Jan-2025 |
Fakultät: | MI - Fakultät für Mathematik und Informatik |
Fachrichtung: | MI - Informatik |
Professur: | MI - Keiner Professur zugeordnet |
Sammlung: | SciDok - Der Wissenschaftsserver der Universität des Saarlandes |
Dateien zu diesem Datensatz:
Datei | Beschreibung | Größe | Format | |
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