Bitte benutzen Sie diese Referenz, um auf diese Ressource zu verweisen: doi:10.22028/D291-44181
Titel: In silico read normalization using set multi-cover optimization
VerfasserIn: Durai, Dilip
Schulz, Marcel H.
Sprache: Englisch
Titel: Bioinformatics
Bandnummer: 34
Heft: 19
Seiten: 3273-3280
Verlag/Plattform: Oxford Univ. Press
Erscheinungsjahr: 2018
DDC-Sachgruppe: 004 Informatik
Dokumenttyp: Journalartikel / Zeitschriftenartikel
Abstract: De Bruijn graphs are a common assembly data structure for sequencing datasets. But with the advances in sequencing technologies, assembling high coverage datasets has become a computational challenge. Read normalization, which removes redundancy in datasets, is widely applied to reduce resource requirements. Current normalization algorithms, though efficient, provide no guarantee to preserve important k-mers that form connections between regions in the graph.
DOI der Erstveröffentlichung: 10.1093/bioinformatics/bty307
URL der Erstveröffentlichung: https://academic.oup.com/bioinformatics/article/34/19/3273/4975418
Link zu diesem Datensatz: urn:nbn:de:bsz:291--ds-441812
hdl:20.500.11880/39514
http://dx.doi.org/10.22028/D291-44181
ISSN: 1367-4811
1367-4803
Datum des Eintrags: 28-Jan-2025
Fakultät: MI - Fakultät für Mathematik und Informatik
Fachrichtung: MI - Informatik
Professur: MI - Keiner Professur zugeordnet
Sammlung:SciDok - Der Wissenschaftsserver der Universität des Saarlandes

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