Bitte benutzen Sie diese Referenz, um auf diese Ressource zu verweisen:
Volltext verfügbar? / Dokumentlieferung
doi:10.22028/D291-28702
Titel: | Bit-parallel sequence-to-graph alignment |
VerfasserIn: | Rautiainen, Mikko Mäkinen, Veli Marschall, Tobias |
Sprache: | Englisch |
Titel: | Bioinformatics |
Verlag/Plattform: | Oxford University Press |
Erscheinungsjahr: | 2019 |
Dokumenttyp: | Journalartikel / Zeitschriftenartikel |
Abstract: | Graphs are commonly used to represent sets of sequences. Either edges or nodes can be labeled by sequences, so that each path in the graph spells a concatenated sequence. Examples include graphs to represent genome assemblies, such as string graphs and de Bruijn graphs, and graphs to represent a pan-genome and hence the genetic variation present in a population. Being able to align sequencing reads to such graphs is a key step for many analyses and its applications include genome assembly, read error correction, and variant calling with respect to a variation graph. |
DOI der Erstveröffentlichung: | 10.1093/bioinformatics/btz162 |
Link zu diesem Datensatz: | hdl:20.500.11880/27705 http://dx.doi.org/10.22028/D291-28702 |
ISSN: | 1367-4803 1460-2059 |
Datum des Eintrags: | 7-Sep-2019 |
Fakultät: | MI - Fakultät für Mathematik und Informatik |
Fachrichtung: | MI - Informatik |
Professur: | MI - Prof. Dr. Tobias Marschall |
Sammlung: | SciDok - Der Wissenschaftsserver der Universität des Saarlandes |
Dateien zu diesem Datensatz:
Es gibt keine Dateien zu dieser Ressource.
Alle Ressourcen in diesem Repository sind urheberrechtlich geschützt.