Bitte benutzen Sie diese Referenz, um auf diese Ressource zu verweisen:
doi:10.22028/D291-44721
Titel: | Expanding the immune-related targetome of miR-155-5p by integrating time-resolved RNA patterns into miRNA target prediction |
VerfasserIn: | Hart, Martin Diener, Caroline Rheinheimer, Stefanie Kehl, Tim Keller, Andreas Lenhof, Hans-Peter Meese, Eckart |
Sprache: | Englisch |
Titel: | RNA Biology |
Bandnummer: | 22 |
Heft: | 1 |
Seiten: | 1-9 |
Verlag/Plattform: | Taylor & Francis |
Erscheinungsjahr: | 2025 |
Freie Schlagwörter: | miR-155-5p CD4+ T cell activation target prediction time-resolved RNA patterns miRnomics transcriptomics |
DDC-Sachgruppe: | 004 Informatik 610 Medizin, Gesundheit |
Dokumenttyp: | Journalartikel / Zeitschriftenartikel |
Abstract: | The lack of a sufficient number of validated miRNA targets severely hampers the understanding of their biological function. Even for the well-studied miR-155-5p, there are only 239 experimentally validated targets out of 42,554 predicted targets. For a more complete assessment of the immune-related miR-155 targetome, we used an inverse correlation of time-resolved mRNA profiles and miR-155-5p expression of early CD4+ T cell activation to predict immune-related target genes. Using a high-throughput miRNA interaction reporter (HiTmIR) assay we examined 90 target genes and confirmed 80 genes as direct targets of miR-155-5p. Our study increases the current number of verified miR-155-5p targets approximately threefold and exemplifies a method for verifying miRNA targetomes as a prerequisite for the analysis of miRNA-regulated cellular networks. |
DOI der Erstveröffentlichung: | 10.1080/15476286.2025.2449775 |
URL der Erstveröffentlichung: | https://doi.org/10.1080/15476286.2025.2449775 |
Link zu diesem Datensatz: | urn:nbn:de:bsz:291--ds-447219 hdl:20.500.11880/39818 http://dx.doi.org/10.22028/D291-44721 |
ISSN: | 1555-8584 1547-6286 |
Datum des Eintrags: | 19-Mär-2025 |
Bezeichnung des in Beziehung stehenden Objekts: | Supplemental data |
In Beziehung stehendes Objekt: | https://ndownloader.figstatic.com/articles/28142778/versions/1 |
Fakultät: | M - Medizinische Fakultät MI - Fakultät für Mathematik und Informatik |
Fachrichtung: | M - Humangenetik M - Medizinische Biometrie, Epidemiologie und medizinische Informatik MI - Informatik |
Professur: | M - Univ.-Prof. Dr. Andreas Keller M - Prof. Dr. Eckart Meese MI - Prof. Dr. Hans-Peter Lenhof |
Sammlung: | SciDok - Der Wissenschaftsserver der Universität des Saarlandes |
Dateien zu diesem Datensatz:
Datei | Beschreibung | Größe | Format | |
---|---|---|---|---|
Expanding the immune-related targetome of miR-155-5p by integrating time-resolved RNA patterns into miRNA target prediction.pdf | 4,7 MB | Adobe PDF | Öffnen/Anzeigen |
Diese Ressource wurde unter folgender Copyright-Bestimmung veröffentlicht: Lizenz von Creative Commons