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doi:10.22028/D291-44167
Titel: | JAMI: fast computation of conditional mutual information for ceRNA network analysis |
VerfasserIn: | Hornakova, Andrea List, Markus Vreeken, Jilles Schulz, Marcel H. |
Sprache: | Englisch |
Titel: | Bioinformatics |
Bandnummer: | 34 |
Heft: | 17 |
Seiten: | 3050-3051 |
Verlag/Plattform: | Oxford Univ. Press |
Erscheinungsjahr: | 2018 |
DDC-Sachgruppe: | 004 Informatik |
Dokumenttyp: | Journalartikel / Zeitschriftenartikel |
Abstract: | Genome-wide measurements of paired miRNA and gene expression data have enabled the prediction of competing endogenous RNAs (ceRNAs). It has been shown that the sponge effect mediated by protein-coding as well as non-coding ceRNAs can play an important regulatory role in the cell in health and disease. Therefore, many computational methods for the computational identification of ceRNAs have been suggested. In particular, methods based on Conditional Mutual Information (CMI) have shown promising results. However, the currently available implementation is slow and cannot be used to perform computations on a large scale. |
DOI der Erstveröffentlichung: | 10.1093/bioinformatics/bty221 |
URL der Erstveröffentlichung: | https://academic.oup.com/bioinformatics/article/34/17/3050/4962493 |
Link zu diesem Datensatz: | urn:nbn:de:bsz:291--ds-441670 hdl:20.500.11880/39527 http://dx.doi.org/10.22028/D291-44167 |
ISSN: | 1367-4811 1367-4803 |
Datum des Eintrags: | 29-Jan-2025 |
Fakultät: | MI - Fakultät für Mathematik und Informatik |
Fachrichtung: | MI - Informatik |
Professur: | MI - Prof. Dr. Bernt Schiele |
Sammlung: | SciDok - Der Wissenschaftsserver der Universität des Saarlandes |
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