Bitte benutzen Sie diese Referenz, um auf diese Ressource zu verweisen: doi:10.22028/D291-43710
Titel: Protocol to isolate nuclei from Chlamydomonas reinhardtii for ATAC sequencing
VerfasserIn: Santhanagopalan, Indu
Netzl, Antonia
Mathur, Tanya
Smith, Alison
Griffiths, Howard
Holzer, Andre
Sprache: Englisch
Titel: STAR Protocols
Bandnummer: 5
Heft: 1
Verlag/Plattform: Elsevier
Erscheinungsjahr: 2024
DDC-Sachgruppe: 004 Informatik
Dokumenttyp: Journalartikel / Zeitschriftenartikel
Abstract: The isolation of sufficient amounts of intact nuclei is essential to obtain high-resolution maps of chromatin accessibility via assay for transposase-accessible chromatin using sequencing (ATAC-seq). Here, we present a protocol for tag-free isolation of nuclei from both cell walled and cell wall-deficient strains of the green model alga Chlamydomonas reinhardtii at a suitable quality for ATAC-seq. We describe steps for nuclei isolation, quantification, and downstream ATAC-seq. This protocol is optimized to shorten the time of isolation and quantification of nuclei.
DOI der Erstveröffentlichung: 10.1016/j.xpro.2023.102764
URL der Erstveröffentlichung: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2666166723007311
Link zu diesem Datensatz: urn:nbn:de:bsz:291--ds-437106
hdl:20.500.11880/39158
http://dx.doi.org/10.22028/D291-43710
ISSN: 2666-1667
Datum des Eintrags: 11-Dez-2024
Fakultät: MI - Fakultät für Mathematik und Informatik
Fachrichtung: MI - Informatik
Professur: MI - Keiner Professur zugeordnet
Sammlung:SciDok - Der Wissenschaftsserver der Universität des Saarlandes

Dateien zu diesem Datensatz:
Datei Beschreibung GrößeFormat 
1-s2.0-S2666166723007311-main.pdf5,03 MBAdobe PDFÖffnen/Anzeigen


Diese Ressource wurde unter folgender Copyright-Bestimmung veröffentlicht: Lizenz von Creative Commons Creative Commons