Bitte benutzen Sie diese Referenz, um auf diese Ressource zu verweisen: doi:10.22028/D291-39048
Titel: First crystal structures of 1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate synthase (DXPS) from Mycobacterium tuberculosis indicate a distinct mechanism of intermediate stabilization
VerfasserIn: Gierse, Robin M.
Oerlemans, Rick
Reddem, Eswar R.
Gawriljuk, Victor O.
Alhayek, Alaa
Baitinger, Dominik
Jakobi, Harald
Laber, Bernd
Lange, Gudrun
Hirsch, Anna K. H.
Groves, Matthew R.
Sprache: Englisch
Titel: Scientific Reports
Bandnummer: 12
Heft: 1
Verlag/Plattform: Springer Nature
Erscheinungsjahr: 2022
Freie Schlagwörter: Enzyme mechanisms
Enzymes
Molecular modelling
Structural biology
X-ray crystallography
DDC-Sachgruppe: 500 Naturwissenschaften
Dokumenttyp: Journalartikel / Zeitschriftenartikel
Abstract: The development of drug resistance by Mycobacterium tuberculosis and other pathogenic bacteria emphasizes the need for new antibiotics. Unlike animals, most bacteria synthesize isoprenoid precursors through the MEP pathway. 1-Deoxy-d-xylulose 5-phosphate synthase (DXPS) catalyzes the frst reaction of the MEP pathway and is an attractive target for the development of new antibiotics. We report here the successful use of a loop truncation to crystallize and solve the frst DXPS structures of a pathogen, namely M. tuberculosis (MtDXPS). The main diference found to other DXPS structures is in the active site where a highly coordinated water was found, showing a new mechanism for the enamine-intermediate stabilization. Unlike other DXPS structures, a “fork-like” motif could be identifed in the enamine structure, using a diferent residue for the interaction with the cofactor, potentially leading to a decrease in the stability of the intermediate. In addition, electron density suggesting a phosphate group could be found close to the active site, provides new evidence for the D-GAP binding site. These results provide the opportunity to improve or develop new inhibitors specifc for MtDXPS through structure-based drug design.
DOI der Erstveröffentlichung: 10.1038/s41598-022-11205-9
URL der Erstveröffentlichung: https://www.nature.com/articles/s41598-022-11205-9
Link zu diesem Datensatz: urn:nbn:de:bsz:291--ds-390486
hdl:20.500.11880/35216
http://dx.doi.org/10.22028/D291-39048
ISSN: 2045-2322
Datum des Eintrags: 16-Feb-2023
Bezeichnung des in Beziehung stehenden Objekts: Supplementary Information
In Beziehung stehendes Objekt: https://static-content.springer.com/esm/art%3A10.1038%2Fs41598-022-11205-9/MediaObjects/41598_2022_11205_MOESM1_ESM.docx
Fakultät: NT - Naturwissenschaftlich- Technische Fakultät
Fachrichtung: NT - Pharmazie
Professur: NT - Prof. Dr. Anna Hirsch
Sammlung:SciDok - Der Wissenschaftsserver der Universität des Saarlandes

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