Please use this identifier to cite or link to this item: doi:10.22028/D291-22805
Title: Fluorescence correlation spectroscopy of autofluorescent proteins and its applications in live cell membranes
Other Titles: Fluoreszenz-Korrelations-Spektroskopie von autofluoreszenten Proteinen und ihre Anwendungen in lebenden Zellmembranen
Author(s): Koyadan Veettil, Seena
Language: German
Year of Publication: 2009
SWD key words: Fluoreszenzkorrelationsspektroskopie
Grün fluoreszierendes Protein
Free key words: fluorescence correlation spectroscopy
green fluorescent proetin
single molecule spectroscopy
DDC notations: 540 Chemistry
Publikation type: Dissertation
Abstract: Fluorescence correlation spectroscopy (FCS) is used for investigating the kinetic processes and molecular interactions by means of the statistical analysis of fluorescence fluctuations. These fluorescence fluctuations which arise from the small confocal volume are due to diffusion, rotation, intersystem crossing, conformational changes or other random effects of the fluorescent molecules under study. Therefore the fluorescent intensity from these fluctuations contains photophysical information on the nature of molecules. The aim of the work described in this thesis is to study the applications of FCS. The thesis is divided into 6 chapters. The theory, experimental setup and applications of FCS are outlined in chapter 1. A method of determining the photostability of autofluorescent proteins by Stern-Volmer plot like analysis is described in chapter 2. Photostability of green (GFP) and yellow fluorescent proteins (YFP) with fluorinated chromophores are analysed by intensity dependent FCS measurements. Such a photostability analysis is continued in chapter 3 with F64L containing GFP mutants. In addition, this chapter also explains a thermal relaxation rate constant of EGFP which is accompanied by the transition between the bright state and the dark state. By wavelength dependent FCS measurements, the protonated state of the Thr203 and Glu222 containing GFP mutants are demonstrated in chapter 4. Chapter 5 describes the effect of membrane potential on the lateral diffusion of the K+(Na+)/H+ exchanger on the membrane of live red blood cell (RBC). Characterization of PLGA (polylactic-co-glycolic acid) nanoparticles tagged with oligonucleotides which are potential drug carriers in pharmaceutical applications are studied in chapter 6.
Die Fluoreszenz-Korrelations-Spektroskopie (FCS) wird benutzt zur Untersuchung kinetischer Prozesse und molekularer Interaktionen auf der Basis einer statistischen Analyse von Fluoreszenz-Fluktuationen. Diese Fluoreszenz-Fluktuationen, die aus einem kleinen konfokalen Volumen stammen, rühren von Diffusion, Rotation, Intersystemübergängen, Konformationsänderungen oder anderen zufälligen Effekten der untersuchten Fluoreszenzmoleküle her. Aus diesem Grund enthält die Fluoreszenz- Intensität dieser Fluktuationen photophysikalische Informationen über die Natur der Moleküle. Es ist das Ziel der in dieser Thesis beschriebenen Arbeit die Anwendungen von FCS zu untersuchen. Die Thesis ist unterteilt in 6 Kapitel. Die Theorie, experimenteller Aufbau und Anwendungen von FCS werden in Kapitel 1 vorgestellt. Eine Methode der Bestimmung der Photostabilität autofluoreszierender Proteine mit Hilfe einer Stern-Volmer-Plot-artigen Analyse ist in Kapitel 2 beschrieben. Die Photostabilität von grün und gelb fluoreszierenden Proteinen (GFP und YFP) mit fluorierten Chromophoren wird mit Intensitäts-abhängigen FCS-Messungen untersucht. Eine derartige Photostabilitäts-Analyse wird in Kapitel 3 mit F64L enthaltenden GFP Mutanten fortgeführt. Dieses Kapitel erklärt außerdem eine Ratenkonstante der thermalen Relaxation von EGFP; diese Relaxation wird begleitet vom Übergang zwischen Hell- und Dunkelzustand. Der protoniert Zustand der Thr203 und Glu222-enthaltenden GFPMutanten wird in Kapitel 4 durch wellenlängen-abhängige FCS-Messungen demonstriert. Kapitel 5 beschreibt den Effekt des Membranpotentials auf die laterale Diffusion des K+(Na+)/H+-Austauschers auf der Membran von lebenden roten Blutzellen. Die Charakterisierung von mit Oligonukleotiden getaggten PLGA-Nanopartikeln (polylacticco-glycolic acid), die potentielle Drug-Carrier in pharmazeutischen Anwendungen darstellen, wird in Kapitel 6 untersucht.
Link to this record: urn:nbn:de:bsz:291-scidok-48937
Advisor: Jung, Gregor
Date of oral examination: 29-May-2009
Date of registration: 4-Jul-2012
Faculty: NT - Naturwissenschaftlich- Technische Fakultät
Department: NT - Chemie
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